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圣湘速度!DeepSeek基因測序全面應(yīng)用方案

2025-02-12 23:27

2月12日,圣湘生物數(shù)智測序系統(tǒng)正式接入DeepSeek,全面應(yīng)用于病原測序解決方案,引領(lǐng)AI醫(yī)療加速落地。呼吸道、測序兩大戰(zhàn)略系統(tǒng)接續(xù)接入DeepSeek,充分展示了圣湘速度和全面擁抱AI的信心。


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今年1月,圣湘生物SansureSeq 1000 高通量測序儀成功獲得國家藥品監(jiān)督管理局頒發(fā)的三類醫(yī)療器械注冊證。該儀器采用先進(jìn)的可逆末端終止測序法,技術(shù)路線與國際主流測序儀高度兼容,能夠?yàn)榕R床診斷和科研應(yīng)用提供精準(zhǔn)、高效的數(shù)據(jù)支持;高通量、高準(zhǔn)確性的特點(diǎn),使其在腫瘤檢測、遺傳病篩查、病原體檢測等多個(gè)領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力。基于該儀器,圣湘生物研發(fā)推出感染性疾病綜合解決方案、遺傳性疾病全基因組測序解決方案、生殖健康解決方案等多種方案,并已在眾多疾病預(yù)防控制中心及醫(yī)院得到應(yīng)用。


此次,圣湘生物數(shù)智測序系統(tǒng)正式接入DeepSeek后,將全面應(yīng)用到mNGS、tNGS、細(xì)菌/病毒基因組、多組學(xué)等產(chǎn)品方案中,結(jié)合增強(qiáng)索引(RAG)技術(shù),整合圣湘生物病原專屬知識庫,輔助醫(yī)生進(jìn)行診斷。患者臨床信息結(jié)合圣湘海量病原微生物基因測序數(shù)據(jù)進(jìn)行模型訓(xùn)練,協(xié)助醫(yī)生回溯病情完整發(fā)展歷程,精準(zhǔn)、自動抓取相應(yīng)指標(biāo)參數(shù),對大量臨床信息梳理呈現(xiàn)并進(jìn)行病原感染分析推理,輔助病原陽性判斷,形成自動化報(bào)告。同時(shí)面對棘手的罕見病原體,檢驗(yàn)醫(yī)生可拋出疑問,隨即收獲海量前沿病原知識,提前預(yù)警重癥危急值,為患者救治爭取寶貴的時(shí)間,筑牢智慧根基。

圣湘生物數(shù)智測序系統(tǒng)操作演示


借助DeepSeek卓越語言理解能力、強(qiáng)大信息檢索能力和推理能力,圣湘生物已著手將其應(yīng)用到mNGS和tNGS的研發(fā)中。一是構(gòu)建并維護(hù)知識庫數(shù)據(jù)庫,對感染病原體生物學(xué)、醫(yī)學(xué)特征、耐藥、毒力及用藥指導(dǎo)等關(guān)鍵信息進(jìn)行高效快速提取,并定期更新知識庫,確保數(shù)據(jù)時(shí)效性和準(zhǔn)確性。二是打造報(bào)告解讀智能體,即結(jié)合多模態(tài)數(shù)據(jù)(基因檢測、影像學(xué)、生化指標(biāo)等),快速解讀測序報(bào)告,提供臨床意義解讀和治療建議。


同時(shí),利用DeepSeek,圣湘生物也將著手解決mNGS測序、tNGS測序、遺傳病輔助診斷系統(tǒng)、多組學(xué)分析系統(tǒng)等痛點(diǎn)難點(diǎn)問題。如數(shù)據(jù)庫龐大且更新麻煩、清洗和篩選方法復(fù)雜;部分近緣病原體識別困難,對報(bào)陽病原體的致病性難以進(jìn)行評估;報(bào)告解讀自動化程度不高,影響整體檢測效率;panel設(shè)計(jì)流程復(fù)雜、周期長;分析系統(tǒng)對于突變的致病性評估準(zhǔn)確性不夠,需花費(fèi)大量人工復(fù)核;多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析困難,早篩biomarker難以確定等。


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近年來,圣湘生物在隱私計(jì)算技術(shù)方向上進(jìn)行了積極探索和布局,通過同態(tài)加密等技術(shù)保障基因數(shù)據(jù)的"可用不可見"。2024年iDASH國際隱私計(jì)算競賽上,公司斬獲同態(tài)加密賽道全球第一名。目前圣湘生物已將隱私計(jì)算及人工智能等先進(jìn)技術(shù)廣泛應(yīng)用于多個(gè)平臺,并在傳染病數(shù)智化系統(tǒng)、測序全景檢測、遺傳病檢測以及慢病檢測等領(lǐng)域進(jìn)行了深度布局。


未來,圣湘生物將基于成熟檢測技術(shù)、多平臺檢測結(jié)果以及診療數(shù)據(jù),通過人工智能算法持續(xù)優(yōu)化預(yù)測準(zhǔn)確性和效率,簡化模型復(fù)雜度,增強(qiáng)模型可用性,提供涵蓋風(fēng)險(xiǎn)預(yù)警、智能化報(bào)告輸出、疾病預(yù)測等全場景的應(yīng)用方案。同時(shí),公司也將利用隱私計(jì)算技術(shù)對模型和數(shù)據(jù)流進(jìn)行同步加密,確保各方數(shù)據(jù)在傳輸和運(yùn)算中的隱私安全與保護(hù)。


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